Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mrps28Q9CY16 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Mrps28Q9CY16 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mrps28Q9CY16 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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