Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Exo5Q9CXP9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Exo5Q9CXP9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms