Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp23Q9CX11 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp23Q9CX11 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms