Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbm8aQ9CWZ3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbm8aQ9CWZ3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms