Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpusd4Q9CWX4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpusd4Q9CWX4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms