Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddx28Q9CWT6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx28Q9CWT6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms