Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tma16Q9CR02 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tma16Q9CR02 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms