Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ykt6Q9CQW1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ykt6Q9CQW1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms