Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Chchd5Q9CQP3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Chchd5Q9CQP3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms