Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rdm1Q9CQK3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rdm1Q9CQK3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdm1Q9CQK3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms