Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ndufb9Q9CQJ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ndufb9Q9CQJ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms