Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpb2Q9CQI7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snrpb2Q9CQI7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms