Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nudt21Q9CQF3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudt21Q9CQF3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudt21Q9CQF3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.4 ms