Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap3bQ9CQE1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nipsnap3bQ9CQE1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms