Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CQ90 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQ90 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQ90 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQ90 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q9CQ90 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q9CQ90 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms