Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Efcab2Q9CQ46 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Efcab2Q9CQ46 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Efcab2Q9CQ46 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms