Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Commd4Q9CQ02 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Commd4Q9CQ02 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms