Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf8Q99PV0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prpf8Q99PV0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms