Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt23Q99PS0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt23Q99PS0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt23Q99PS0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms