Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rrbp1Q99PL5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rrbp1Q99PL5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rrbp1Q99PL5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rrbp1Q99PL5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms