Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim8Q99PJ2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim8Q99PJ2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms