Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NsmfQ99NF2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NsmfQ99NF2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NsmfQ99NF2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms