Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bco2Q99NF1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bco2Q99NF1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bco2Q99NF1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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