Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rims1Q99NE5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rims1Q99NE5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rims1Q99NE5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms