Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vgll1Q99NC0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vgll1Q99NC0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms