Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl3Q99N95 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl3Q99N95 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms