Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl43Q99N89 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mrpl43Q99N89 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms