Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd1Q99MV1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd1Q99MV1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms