Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SrrtQ99MR6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SrrtQ99MR6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms