Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme5Q99MH5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme5Q99MH5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms