Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprtQ99M80 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprtQ99M80 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprtQ99M80 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprtQ99M80 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprtQ99M80 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprtQ99M80 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprtQ99M80 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PtprtQ99M80 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PtprtQ99M80 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PtprtQ99M80 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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