Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cstf3Q99LI7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cstf3Q99LI7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms