Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp5lQ99LH9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms