Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnpo2Q99LG2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnpo2Q99LG2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms