Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab28Q99KL7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab28Q99KL7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms