Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nlgn1Q99K10 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nlgn1Q99K10 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlgn1Q99K10 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms