Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim11aQ99J19 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smim11aQ99J19 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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