Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Csmd1Q923L3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Csmd1Q923L3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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