Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nrif1Q923B3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nrif1Q923B3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms