Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf3Q922U1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf3Q922U1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf3Q922U1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prpf3Q922U1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prpf3Q922U1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Prpf3Q922U1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf3Q922U1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf3Q922U1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms