Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tubb6Q922F4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tubb6Q922F4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tubb6Q922F4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms