Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sf3b3Q921M3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sf3b3Q921M3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b3Q921M3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b3Q921M3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b3Q921M3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b3Q921M3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b3Q921M3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b3Q921M3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sf3b3Q921M3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms