Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pde6cQ91ZQ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
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Pde6cQ91ZQ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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Pde6cQ91ZQ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Pde6cQ91ZQ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Pde6cQ91ZQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Pde6cQ91ZQ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Pde6cQ91ZQ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Pde6cQ91ZQ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Pde6cQ91ZQ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pde6cQ91ZQ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pde6cQ91ZQ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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