Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atl3Q91YH5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atl3Q91YH5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atl3Q91YH5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms