Protein–RNA interactions for Protein: Q91WB7

Ubtd1, Ubiquitin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubtd1Q91WB7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubtd1Q91WB7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ubtd1Q91WB7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms