Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usb1Q91W78 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usb1Q91W78 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms