Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp3Q91W36 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp3Q91W36 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms