Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhbdd2Q8VEK2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms