Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc71Q8VEG0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc71Q8VEG0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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