Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SnrkQ8VDU5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrkQ8VDU5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrkQ8VDU5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms